Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf1Q5ND28 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms