Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms