Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Trim58Q5NCC9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Trim58Q5NCC9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Trim58Q5NCC9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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