Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnni3kQ5GIG6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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