Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q5EBG8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Q5EBG8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q5EBG8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q5EBG8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q5EBG8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q5EBG8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q5EBG8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5EBG8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5EBG8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms