Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc8bQ5DU41 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms