Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp22Q5DU02 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms