Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms