Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Fam208bQ5DTT3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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