Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms