Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opa3Q505D7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms