Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srek1ip1Q4V9W2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms