Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Trp53i11Q4QQM4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Trp53i11Q4QQM4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trp53i11Q4QQM4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trp53i11Q4QQM4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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