Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms