Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa20Q45VN2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms