Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms