Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SvipQ3UZP4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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