Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc114Q3UX62 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms