Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim40Q3UWA4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim40Q3UWA4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim40Q3UWA4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim40Q3UWA4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim40Q3UWA4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim40Q3UWA4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim40Q3UWA4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim40Q3UWA4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms