Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms