Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms