Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms