Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230104I21RikQ3USW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B230104I21RikQ3USW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms