Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rbm20Q3UQS8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rbm20Q3UQS8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rbm20Q3UQS8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rbm20Q3UQS8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rbm20Q3UQS8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Rbm20Q3UQS8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbm20Q3UQS8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms