Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms