Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms