Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mccc2Q3ULD5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mccc2Q3ULD5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms