Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smu1Q3UKJ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms