Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcgf5Q3UK78 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcgf5Q3UK78 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms