Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b2Q3UJB0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms