Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms