Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Greb1Q3UHK3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms