Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LchnQ3UHG7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LchnQ3UHG7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms