Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx27Q3UHD6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms