Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc177Q3UHB8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms