Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms