Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms