Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms