Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brf2Q3UAW9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms