Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms