Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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Rnf40Q3U319 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf40Q3U319 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Rnf40Q3U319 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf40Q3U319 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf40Q3U319 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf40Q3U319 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Rnf40Q3U319 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Rnf40Q3U319 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Rnf40Q3U319 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Rnf40Q3U319 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf40Q3U319 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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