Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam193bQ3U2K0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam193bQ3U2K0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms