Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms