Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a5Q3TYU2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms