Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbxip1Q3TVI8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbxip1Q3TVI8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms