Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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