Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc136Q3TVA9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc136Q3TVA9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms