Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf17Q3TUL7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf17Q3TUL7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms