Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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