Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde12Q3TIU4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde12Q3TIU4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms